I "Chapterhouse: Dune" fullfører Frank Herbert sitt episke Dune-kapittel, en av de mest solgte science fiction-fortellingene gjennom tidene. Den ørkenplanet Arrakis, kjent som Dune, er blitt ødelagt. Restene av det gamle imperiet er blitt utslettet av en voldsom matriarkalsk kult kjent som Honored Matres. Den eneste gjenværende fraksjonen som utgjør en reell trussel mot deres totale erobring, er Bene Gesserit, arvingene til Dunes makt. Ledet av Mor Superior Darwi Odrade, har Bene Gesserit kolonisert en grønn verden på planeten Chapterhouse, hvor de systematisk forvandler landskapet til ørken, mile for mile. Når de mestrer avl av sandormer, vil Søsterhood kontrollere produksjonen av den mest verdifulle varen i den kjente galaksen – krydderet melange. Men deres sanne våpen er en mann som har levd utallige liv, en mann som tjente under Gudkeiseren Paul Muad'Dib.
