I 'Troubled Waters' møter vi milliardæren Ian Shaw, en mann som tilsynelatende har alt, unntatt den lykken han lengter etter. Etter en nylig likvidering av formuen sin er livet hans i kaos; den kjære niesen hans, Esme, er savnet, og kvinnen han elsker, Sierra Rose, ignorerer ham. Ian har mistet troen på at hun ville ha ham, selv om de befant seg isolert på en øde øy. Mens Sierra bærer en hemmelighet som uunngåelig skaper avstand mellom dem – hun har faktisk løst mysteriet rundt Esmes forsvinning, men har lovet niesen å holde hennes opphold skjult. Når PEAK-helikopteret deres får en alvorlig skade og Sierra mangler penger til reparasjonen, tilbyr Ian å arrangere en innsamlingsreise på sin luksusyacht i Karibien for store donorer. Men den tre dager lange ekskursjonen utvikler seg til et mareritt når en uventet bølge rammer yachten og sender passasjerene over bord. Med både panikk og vannsprut, får Ian endelig muligheten til å teste teorien sin når han og Sierra må kjempe for å overleve sammen.