I tidlig attenhundretall i Lisboa følger vi historien om Baltasar, en soldat som har mistet sin venstre hånd i kamp. Han forelsker seg i Blimunda, en ung kvinne med visjonære evner. Fra det øyeblikket han følger henne hjem fra en auto-da-fé, hvor kvinner blir brent på bålet, er de bundet sammen av en kjærlighet som er sterkere enn alt annet. Denne kvelden blir de også besøkt av Padre Bartolomeu Lourenço, hvis drøm er å konstruere en flymaskin. Mens Kronen og Kirken kolliderer i sine verdier og mål, jakter de på hans upraktiske, for ikke å si heretiske, drøm om å fly.