Ammonius, en sentral skikkelse innen den neoplatoiske tradisjonen på 500-tallet, stod bak undervisningen av flere fremtredende tenkere i sin tid. Han brakte med seg metodene fra sin lærer, Proclus, fra Athen til Alexandria, noe som fikk stor betydning for utviklingen av filosofisk tenkning. I sitt kommentarverk til Aristoteles' Kategorier presenterer han en rekke innledende spørsmål som beriker forståelsen av teksten, og som senere skulle bli ansett som standard for slike kommentarer. Dette verket gir en fascinerende innsikt i den religiøse situasjonen i Alexandria på den tiden. Det ble påstått at den neoplatoiske skolen i Alexandria fikk fortsette sin virksomhet etter at den athenske skolen ble stengt, delvis fordi Ammonius hadde inngått en avtale med de kristne myndighetene om å holde sine religiøse synspunkter for seg selv. Imidlertid viser hans kommentarer at han åpent og fritt bekjente seg til de neoplatoiske guddommer. De filosofiske problemstillingene som Ammonius tar opp, gir en unik forståelse av innholdet i Aristoteles' Kategorier, og utfordrer leseren til å tenke kritisk og dykke dypere inn i temaet. Moderne lesere vil ha stor nytte av å stille de samme spørsmålene til seg selv.