Coraline oppdager snart at det er noe merkeligt med sitt nye hjem. Det er ikke bare den tåkete atmosfæren eller katten som alltid synes å overvåke henne, men også advarslene fra hennes nye naboer, Miss Spink og Miss Forcible, som leser faretegn i tebladene. Det som virkelig fascinerer henne er det gamle døren i stuen, som leder til en annen verden. I denne alternative virkeligheten møter Coraline en annen mor og far, med svarte knapper for øyne og papiraktig hud, som venter på at hun skal bli med dem. De ønsker at hun skal bli hos dem for alltid. Coraline forstår at dersom hun krysser denne terskelen, kan det få fatale konsekvenser, og hun kan ende opp med å aldri komme tilbake til sin egen virkelighet.