Når Coraline flytter inn i et nytt hus, blir hun fascinert av at huset faktisk bare er halvparten av et hus. Det har vært delt opp i leiligheter for mange år siden, og det blir snart tydelig for Coraline at den andre leiligheten ikke er så koselig og trygg som hennes egen. Coralines nysgjerrighet fører henne inn i en verden full av mystikk og skremmende overraskelser, der hun oppdager hemmeligheter som vil forandre livet hennes for alltid.