Kampen for å redde menneskeheten har begynt. Utenfor kysten av Antarktis finner et forskningsfartøy en mystisk struktur begravet dypt i en isbre. Denne strukturen har vært innelåst i tusenvis av år og er åpenbart ikke menneskeskapt. Men en hemmelig og ubarmhjertig gruppe vet hva den er... og hva den betyr. Immari-kabalen har brukt årtusener på å forberede seg på den antikvitetens fiende som snart skal vende tilbake. Konfrontert med en trussel som kan utslette menneskeheten, mener de at menneskehetens eneste mulighet for overlevelse vil innebære å ofre 99,9 % av jordens befolkning. Det er en pris Immari er villige til å betale. Genetiker Kate Warner og etterretningsoffiser David Vale kan ha en sjanse til å avverge den forestående katastrofen, men det avhenger av at de kan avkode hemmelighetene bak Atlantis-genet og avdekke sannheten om menneskehetens opprinnelse.
