I 1966, da krigen trappes opp, får en ung nyutdannet fra Luftforsvaret i oppgave å patruljere fiendtlige områder sammen med seksmanns hunter-killer team. Som Forward Air Controller, som flyr enmotoryet spotterfly, fungerer Flanagan som bindeleddet mellom jagerbombepilotene og bakkestyrkene. Denne selvbiografiske beretningen gjenopplever tiden da Flanagan, tildelt Project Delta, ble kastet inn i store operasjoner i essensielle kampområder. Her finnes det spektakulære luftangrep, redningsaksjoner, tapte menn og mislykkede forsøk på å redde kamerater, alt skildret med brutal ærlighet. Boken presenterer en faktabasert kampdokumentasjon fra én manns perspektiv, men den gir også en tankevekkende refleksjon over krigervalgene som mot, ærlighet og integritet. Flanagan gransker de faktorene som bidrar til å forme disse verdiene, inkludert utdanningsinstitusjoner, det militære treningssystemet (deriblant serviceakademiene) og religion, samt reflekterer over den høye prisen ved å forlate dem. I Vietnam Above the Treetops, skildrer Flanagan sin livsreise fra ungdomstiden.
