I 'Blodrøde Arresø' følger vi biografmanden Thorkild Fleischer som ankommer til London i 1940, hvor han får i oppdrag å samarbeide med det danske motstandsbevegelsen og den allierte filmsektionen. Målet er å bringe engelske dokumentarfilmer til Danmark, filmer som skal vises illegalt i private hjem. Under sitt opphold møter han en gåtefull kvinne som påstår å være en dansk journalist og antinazist, men hvem er hun egentlig? Samtidig, i 2021, sitter to lystfiskere ved Arresø og nyter en vakker sensommerdag. Plutselig får de napp og drar opp en enorm gedde. I fiskens mave finner de en sjelden engelsk gullmynt, som viser seg å ha en stor verdi. Deres deltagelse i en auksjon utløser en konflikt om eierskapet til de millionene mynten kan potensielt gi. Spenningen tiltaser når politiet i 2021 finner Thorkild Fleischer død i den gamle militære havnen ved Arresø. Var det selvmord eller drap? Politikommissær Bjørn Jonasen og hans team må nå grave dypere i hendelsene som ledet opp til hans død, og avdekke sannheten om både mynten og Fleischer.
