I "Lost Harbor" følger vi historien om Alice Johns og Bridget Moore, to unge nonner som opplevde en forbuden kjærlighet. Da de ble oppdaget, ble de tvunget til å forlate klosteret og mistet kontakten. Men minnene om deres intense bånd har aldri falmet. Tjuefem år senere møter de hverandre igjen, og gnisten mellom dem er fortsatt like sterk. Utenfor klosterets murer lever de to liv som er helt forskjellige. Alice lever et stille og rolig liv, er aktiv i menigheten sin og unngår å snakke om sin fortid som nonne. Bortsett fra lengselen etter sin første og eneste kjærlighet, har hun funnet lykken i sin valgte familie i Oceana. I kontrast til Alice finner vi Bridget, en utadvendt salgsleder, som har utvidet sitt liv i årene siden de to var sammen. Hun har lært at livet innebærer mer enn jobb, og har også tatt avstand fra religion. Når de gjenforenes, opplever de en dyp lidenskap, men de bekymrer seg for hvordan de har utviklet seg ulikt. For at kjærligheten deres skal overleve, må de finne en måte å forene sine mest verdifulle lidenskaper på.
