Molekylær dynamikk-simulering er en ekstremt kraftig teknikk som løser det klassiske mange-kropp problemet i sammenhenger som er relevante for studiet av materie på atomnivå. Det finnes ingen alternativ metode som kan håndtere dette brede spekteret av problemer på det nødvendige detaljnivået, noe som gjør molekylær dynamikk-metoder uunnværlige både i ren og anvendt forskning. Denne boken kombinerer en pedagogisk tilnærming med en samling av oppskrifter, og gir dermed en introduksjon til emnet for nybegynnere, samtidig som den fungerer som en referanse for mer erfarne utøvere. Boken er strukturert som en serie casestudier som leder leseren gjennom hver av trinnene fra problemformulering, utvikling av nødvendig programvare, og videre til bruk av programmene for å utføre faktiske målinger. Den andre utgaven av boken inneholder et betydelig antall nye materialer samt fullstendig omskreven programvare.
