I 'Storm i Havanna' står Dirk Pitt overfor en alvorlig trussel: Et giftig utslipp i det Karibiske hav kan potensielt ødelegge klimaet langs USAs kyst. Plutselig befinner han seg midt i en intens politisk maktkamp i det post-Castro Cuba, der farene er mange og motstanderne få. Samtidig er Pitts egne etterkommere, marinbiolog Dirk og oseanograf Summer, dypt involvert i en jakt på en sjelden stein som kan være nøkkelen til en historisk azteker-skatten. Problemet er at denne steinen trolig ble destruert på et slagskip i Havanna så tidlig som i 1898. Deres eventyr tar dem til Cuba, et sted der situasjonen raskt blir mer og mer spent. Pitt-familien har alltid vært vant til å håndtere farer, men denne gangen kan konsekvensene bli mer omfattende enn noensinne.