I takt med at etterforskere avdekket de pakkede restene av flere dusin unge menn fra et lite hus i Chicago, fikk eieren av huset, John Gacy, raskt oppmerksomheten fra både medier og publikum. Gacy, som var en respektert borger og aktiv i lokal politikk og veldedighet, var også kjent for sine temafester og sitt alter ego som Pogo-klovnen. Men i vinteren 1978–79 ble han en del av listen over de såkalte 'seksuelle morderne', som begynte å vinne notoritet på grunn av den tilfeldige brutaliteten som preget 1970-tallet. Etter hvert som interessen fra offentligheten økte, ble ofrene redusert til fotnoter og statistikk, liv som ble tapt ikke bare på grunn av vold, men også til historien. Gjennom vitnesbyrd fra søsken, foreldre, venner, elskere og andre som var nært knyttet til saken, tar 'Boys Enter the House' oss med på en reise gjennom ofrenes liv, tilbake til inngangsdøren til Gacy-huset. Midt i de slitte gatene i Uptown-nabolaget utspiller Samuel Stapleton og Randy Reffett en gutteduell som former deres skjebne.
