Klonekrigene har startet, og kampene trekker opp linjene i hele galaksen. Hver verden som slutter seg til Separatistene gjør at den freden som Jediordenen har voktet, glipper stadig mer. Etter at en eksplosjon herjer Cato Neimoidia, som er en juvel for Handelsforbundet, plasseres skylden på Republikken, og den skjøre nøytraliteten til planeten er i fare. Jedi sender ut Obi-Wan Kenobi, en av ordenens mest begavede diplomater, for å undersøke forbrytelsen og opprettholde balansen som nå begynner å skifte farlig. Med hjelp fra en heroisk Neimoidian-vakt, avdekker Obi-Wan en sammensvergelse fra Separatistene, som håper å dra planeten inn i kaos, og merker Asajj Ventress sin sinistere hånd som skjuler seg i tåken over planeten. Midt i dette voksende kaoset, stiger Anakin Skywalker til rang som Jedi-ridder. Til tross for direktivet om at Obi-Wan skal reise alene, og hans tidligere mesters insistering på at han må lytte denne gangen, innser Anakin at hans sta vilje kan spille en avgjørende rolle.