I 'Mega Robo Bros: Nemesis' møter vi Alex og Freddy, som står overfor en kritisk situasjon når REVOLUTION-malwaren får roboter i London til å angripe mennesker. Mellom lojaliteten til sine menneskelige venner og familien, og ønsket om å støtte roboter som dem selv, må de ta vanskelige valg. De vet ikke hvem som står bak denne onde planen, men situasjonen eskalerer raskt. En gammel fiende, som man trodde var død, dukker uventet opp, og bruker sine onde krefter til å overta Freddys robotevner. Dette sender Freddy på en destruktiv kurs mot London. Kan Alex redde sin bror fra den fordervende innflytelsen til den skurkeaktige Robot 23, og stoppe kaoset som truer byen? Bli med i dette spennende eventyret fylt med spenning, vennskap og kampen mellom det gode og det onde.
