I en post-apokalyptisk verden hvor overlevelse står i fokus, skildrer 'Deadman Wonderland, Vol. 5' en surrealistisk historie om en prison som er bygget opp fra ruinene av Tokyo. Den unge mellomtrinnseleven Ganta Igarashi har fått skylden for de brutale drapene på sine klassekamerater av den mystiske Røde Mannen, og står nå overfor dødsstraff. Han blir sendt til Deadman Wonderland, en bisarr og livsfarlig fornøyelsespark/prison som har oppstått etter den store jordskjelvet i Tokyo—et helvete på jord. Når Scar Chains leder blir tatt til fange, blir oppstanden deres motarbeidet av Undertakers. Ganta ønsker å trene for å lære å bruke sine krefter, kjent som Branch of Sin, samtidig som han er klar over at han dykker dypere inn i de dødelige planene som ulmer i fengselet. Den avgjørende kampen mellom Scar Chain og Undertakers nærmer seg, men hva skjer egentlig når den ene siden taper?