I 'Den hemmelige dagboken av Anna Stuart' blir vi ført tilbake til to tidsepoker i England, fylt med dramatiske hendelser og personlige kamper. I 1945 møter vi Nancy Jones, en ung artillerijente som spiller en essensiell rolle i forsvaret av landet under den andre verdenskrigen. Med et skarpt blikk overvåker hun luftrommet over Storbritannia, stadig på vakt mot fiendens fly. Ansvarsbyrden er stor, men det gir henne også en følelse av å være levende og å bidra til noe større. En skjebnesvanger beslutning en kveld endrer alt for henne. Etter krigens slutt gifter hun seg med sin kjæreste og flytter inn i et idyllisk hus på landsbygda, der ektemannen skal arbeide som viltvokter. Her håper Nancy å finne fred og legge de forferdelige minnene fra krigen bak seg. I 2019 opplever vi Lorna Hayes' tragedie. Etter å ha mistet ektemannen, flytter hun inn hos moren og stefaren for å bearbeide sorgen og finne trygghet for seg selv og sine to sønner. Denne gripende historien vever sammen fortid og nutid, og utforsker hvordan krigens skygger fortsatt kan påvirke livene til de som står igjen.
