I "Under Ninja, Volume 2" møter vi Kudo, som nå har fått tak i moderne ninja-utstyr. Han begynner å utforske de tøffe gatene i Tokyo med sitt nye verktøysett. Uten at han vet om det, befinner en russisk agent seg i byen, med ondsinnede planer om å forstyrre Japans ninja-korps. Mens Kudo fortsatt er fersk og ikke helt opplært, blir han satt i alarmberedskap for å håndtere en terrortrussel i storbyen. Det viser seg at denne agenten også besitter ninja-ferdigheter, noe som skaper en intens konfrontasjon. Følg Kudo på hans spennende reise i en verden der tradisjon møter moderne trusler, i en thriller fylt med action og intriger.