Etter en lang pause er Kurou klar for å gå tilbake til skolen. Som en person som har vært lite motivert for læring, har ikke studier vært hans sterkeste side. Men nå krever ikke 'oppdraget' hans nødvendigvis at han åpner bøker. På campus ser det ut til at hans prioriteringer dreier seg om å holde det rivaliserende ninja-klanen i sjakk, mens Under Ninja forsøker å kaste regionene ut i kaos!