Dorohedoro, Vol. 6 tar leserne med på en skremmende reise gjennom en dystopisk by kjent som 'hullet', hvor en gruppe sadistiske trollmenn plukker mennesker fra gaten for å bruke dem som forsøkspersoner i sine grusomme eksperimenter med svarte kunster. I en mørk bakgate finner Nikaido Caiman, en mann med et reptilhode og kraftig hukommelsestap. For å bryte forbannelsen, jakter de på og eliminerer trollmennene i hullet, i håp om at de til slutt vil finne den rette. Når En, lederen av trollmennene, får høre om en øglemann som slakter folkene hans, sender han inn en gruppe 'rensere' for å rydde opp, noe som utløser en voldsom konflikt mellom de to verdnene. Caiman har forlot hullet for trollmennenes dimensjon i et forsøk på å avdekke hemmelighetene fra fortiden sin. Samtidig som trollmennenes 'Blå Natt'-festival nærmer seg slutten, blir Nikaido tatt til fange. Den overnaturlige mafia-bossen En har fått en usunn interesse for hennes evner, som kan vise seg å være langt mer unike og kraftfulle enn noen har forestilt seg.