Forestill deg å våkne opp i en verden der alle mennesker har blitt mystisk forvandlet til stein. En skjebnesvanger dag ble hele menneskeheten til stein. Mange tusen år senere klarer Taiju å frigjøre seg fra denne pietifiserte tilstanden og finner seg selv blant statueaktige skikkelser. Situasjonen ser håpløs ut, helt til han møter sin vitenskapsinteresserte venn Senku! Sammen legger de en plan for å gjenopprette sivilisasjonen ved hjelp av vitenskapens krefter. Senku, Taiju og Yuzuriha er godt i gang med å lage krutt når de får øye på røyk som stiger opp i horisonten. Overbevist om at dette er et tegn på andre mennesker, tar Senku en stor risiko ved å sende opp sitt eget røyksignal. Samtidig er Tsukasa fast bestemt på å stoppe deres fremgang med kruttet, og hans ankomst kan bety slutten for heltene våre!
