I 1866 utspiller det seg merkelige hendelser på verdenshavene. Skipene som seiler på de dype, blå havene, opplever skremmende møter med et mystisk vesen – et selvlysende monster, mye større og raskere enn en hval. I jakten på anatomiens gåte, blir fregatten Abraham Lincoln bedre rustet med datidens mest avanserte våpen og et dyktig mannskap. Blant dem finner vi den franske vitenskapsmannen Pierre Aronnax, hans trofaste tjener Conseil og den modige kanadiske harpunéren Ned Land. Da Abraham Lincoln til slutt kommer ansikt til ansikt med monsteret, fører en voldsom konfrontasjon til at de tre mennene blir kastet over bord. I sin desperate situasjon finner de seg selv på ryggen av den fantastiske ubåten Nautilus. Under ledelse av den gåtefulle kaptein Nemo begynner de på en reise som ingen andre har opplevd: en episk verdensomseiling i dypet av havet. De oppdager utrolige eventyr og unike naturfenomener som er helt utenfor rekkevidde for vanlige mennesker. Dypet skjuler en skattekiste av liv: eksotiske skapninger, sjeldne planter, gnistrende fisk, perler, og til og med gull. En uforglemmelig reise gjennom den skjulte verden under havoverflaten venter.