I "The Otaku in 2200 A.D., Part 2" følger vi Oota, som nå er på flukt etter å ha oppdaget at han er en virkelig menneskelig skapning. President Momo-chan har sendt sine mest formidable og attraktive agenter for å finne og eliminere ham. Sammen med Naomi finner Oota tilflukt i den undervannsbyen O-Bio, et fristed for lesbiske med enestående teknologi, fylt med bio-skapt monsterjenter og andre fantastiske kroppsmutasjoner. De er på leting etter byens leder, Jura, som har evnen til å fremkalle en liknende nivå av seksuell eufori som Momo-chan. Utfordringen er imidlertid at O-Bio har strenge regler mot mannlige innbyggere. Hvordan skal Oota klare å holde seg i skinnet i nærværet av alle disse fortryllende skapningene og samtidig opprettholde sin anonymitet?
