I en fjern fremtid der solen ikke lenger skinner, tar Toshiro Kamiya det skjebnesvangre valget om å gi opp kroppen sin til en dyster, floral metamorfose for å oppnå en lønn. Jorden er dekket av tykke skyer, og solens stråler når ikke lenger bakken. Plantene visner, og oksygenet er knapt. Som en respons på denne truende utryddelsen, har menneskeheten utviklet teknologi som forvandler mennesker til planter, noe som gir en beskjeden mengde oksygen. Men er denne prosessen bærekraftig? Er den etisk? Toshiro Kamiya står overfor disse spørsmålene når han må ta en vanskelig avgjørelse – skal han redde sin familie eller redde seg selv? Mens han kjemper mot fattigdom og gjennomgår en langsom forvandling, må Kamiya finne ut hvordan han best kan bruke de to korte årene av menneskelivet han har igjen etter å ha gjennomgått transfloriseringsprosedyren. Vinen som vokser ut fra magen hans får ham til å stille spørsmål ved forholdet til moren sin og hans arbeid hos Transflora Medical. Samtidig hjelper Toshiros barndomsvenn, Hourai, til med etterforskningen av en rekke mord begått av en spiriflor.
