I en fjern fremtid der solen ikke lenger skinner, tar Toshiro Kamiya det lite fristende steget mot en skummel blomstrende metamorfose for å sikre seg en belønning. Verdens overflate er innhyllet i tykke, truende skyer, og solens lys er en sjeldenhet. Planter visner, og oksygenet er faretruende tynt. Som svar på denne nærstående utryddelsen, har menneskeheten utviklet teknologi som forvandler mennesker til planter i et forsøk på å generere en liten mengde oksygen. Men er denne prosessen bærekraftig? Er det etisk riktig? Toshiro blir stilt overfor disse utfordrende spørsmålene idet han må ta en vanskelig beslutning—redde sin familie eller redde seg selv. Når Hourai kommer seg etter Ivys brutale angrep, kaster Toshiro seg inn i etterforskningen av den nådeløse spiriflorens opprinnelse. Denne reisen leder ham til en by kalt Paupertown. Hvilke skumle hemmeligheter venter ham i byens mørke og triste dyp?
