Genome-Scale Algorithm Design av Veli (University of Helsinki) Makinen, Djamal (Centre de Recherche sur l'Information Scientifique et Technique (
Produktbeskrivelse
Boken 'Genome-Scale Algorithm Design' presenterer de grunnleggende algoritmene og datastrukturene som er essensielle for bioinformatikkarbeid. Den tar for seg et bredt spekter av emner, fra fundamentene i sekvensanalyse, som justeringer og skjulte Markov-modeller, til klassiske indeksstrukturer som k-mer indekser, suffix-arrays og suffix-trær. Videre behandles Burrows–Wheeler indekser, graf-algoritmer, nettverksflyt og flere avanserte applikasjoner innen omics. Kapitlene inneholder mange eksempler, visualiseringer av algoritmer, samt øvelser, noe som gir både masterstudenter, forskere og praktikere et kraftfullt verktøy for anvendelse av høyhastighetssekvensering. Boken har en tilhørende nettside (www.genome-scale.info) som tilbyr støttemateriale for undervisning. Den andre utgaven styrker verktøysettet ytterligere ved å inkludere minimizers og andre avanserte datastrukturer, samt deres bruk i fremvoksende tilnærminger innen pangenomikk.