I "Piranha" tar Juan Cabrillo og mannskapet på Oregon seg gjennom en spennende og farlig situasjon når en skarpsindig forsker avdekker deres hemmelige oppdrag. Handlingen finner sted i 1902, da vulkanen Mt. Pelée formerer sin kraft på øya Martinique og utsletter en hel by med tretti tusen innbyggere, samtidig som et skip med en tysk vitenskapsmann på randen av en banebrytende oppdagelse synker. Mer enn et århundre senere, må Cabrillo konfrontere arven etter denne forskeren. Under en hemmelig operasjon planlegger Cabrillo og hans besetning å bluffe med synket av Oregon, men en ukjent fiende oppdager dem til tross for deres grundige forberedelser og prøver å ta dem av dage. Cabrillo og teamet står overfor en motstander som ser ut til å forutsi hvert eneste av deres trekk. De oppdager at en forrædersk amerikansk våpensdesigner har fullført det tyske vitenskapsmannens arbeid, noe som gir ham ekstraordinær makt. Nå må Oregon konkurrere mot klokken for å stoppe et angrep som kan få katastrofale konsekvenser.