Pedro Arrupe ble født i Bilbao, den største byen i den spanske baskerland, i 1907. Han begynte sin karriere som lege, men etter å ha vært vitne til mirakuløse helbredelser i Lourdes, bestemte han seg for å bli en sjelens helbreder i stedet, og han sluttet seg til Jesuittordenen i 1927. Arrupe ble sendt til Japan, men under utbruddet av andre verdenskrig ble han satt i isolasjon og forhørt, mistenkt for å være en amerikansk spion. I denne perioden reflekterte han over sin læreprosess, og sa: 'Jeg tror dette var måneden jeg lærte mest i hele mitt liv.' I august 1945, bare to miles fra sentrum av Hiroshima, var fader Arrupe vitne til at atombomben ble sluppet. Hans medisinske ferdigheter lindret lidelsen til mange, og han beskrev denne opplevelsen som 'en permanent erfaring utenfor historien, graveret i min hukommelse.' Men det meste bemerkelsesverdige arbeidet i far Arrupes liv var fortsatt foran ham. I 1965 ble han valgt til general for Jesuittordenen, ansvarlig for 36 000 menn over hele verden. På den tiden var jesuittene den største religiøse ordenen i verden. Hans tid som general var kritisk for organisasjonens utvikling.