Den unge Rachel Kalama vokser opp i det idylliske Honolulu på 1890-tallet, og drømmer om å oppdage fjerne land. Men når hun er bare syv år, blir hennes drømmer knust av en sjokkerende diagnose: hun har lepra. Tvangsfjernet fra familien, sendes hun til en avsidesliggende leprosy-bosetting på øya Moloka'i. I sitt eksil finner Rachel et nytt fellesskap av venner, som blir som en ny familie for henne. Likevel henger tapet over henne som en konstant skygge, mens hun ser de hun elsker lide under sykdommens grusomheter. Moloka'i er en gripende fortelling om håp, verdighet og den menneskelige ånds styrke.