'Wayne of Gotham' skildrer historien om to menn som er adskilt av en generasjon fylt med tragedie: Thomas, den opprørske arvingen til det enorme Wayne-imperiet, og Bruce, hans sønn, hvis liv for alltid forandres etter å ha vært vitne til drapet på Thomas. Mordet på Thomas og Martha Wayne blir det smertefulle vendepunktet som får Bruce til å bli Batman. Den mørke ridderens sak om dette mordet har lenge vært nøye arkivert, og grunnlaget for Bruce Waynes hemmelige liv er trygt plassert i den enkle symmetrien av et ran som gikk forferdelig galt. Men når forstyrrende informasjon begynner å dukke opp på Batmans vei og stiller spørsmål ved den aksepterte fortellingen, blir fundamentene rystet. Batman gjenåpner saken og avdekker sannheter om en far og en mor han aldri kjente, samt vekten av et mørkt arvegods han nå må bære.