Verden står overfor et katastrofalt nederlag i kampen mot en dødelig infeksjon som har forvandlet mennesker til livløse skygger av seg selv. En farlig patogen herjer og etterlater sine ofre i en tilstand mellom liv og død. New York, et livlig symbol på menneskelig storhet, er nå reduseres til radioaktiv ruinhauger etter at byen ble bombet for å hindre smitte. I en desperat innsats for å redde menneskeheten, dykker et redningsmannskap inn i metroen under Manhattan, i en søken etter en genial vitenskapsmann som besitter kunnskapen til å skape en motgift. Mennene i redningslaget må krige mot flomvann, dødelig stråling og infiserte overlevende som er blitt strålesyke, mens de kjemper mot klokken i en kamp som kan avgjøre menneskehetens skjebne.