Neste kapittel av Codename G.I. Joe starter her. Shana "Scarlett" O'Hara står overfor den mest risikofylte svart operasjonsoppgaven i sin karriere: å infiltrere den mystiske, voksende makten i Japan kjent som Clan Arashikage. Hennes eneste spor er hennes tidligere partner, Jinx, som nå er en Arashikage-håndhever. Scarlett må nå bruke sine unike ferdigheter for å overleve under dekke... og avdekke et sjokkerende våpen som kan endre maktbalansen på jorden.