I Manazuru møter vi Kei, en kvinne som befinner seg i skjæringspunktet mellom fortid og framtid. Tolv år har gått siden ektemannen Rei forsvant, og Kei står alene med ansvaret for sin tre år gamle datter. I hun har inngått et nytt forhold til en gift mann, en som står i kontrast til Rei, men som også har ført henne inn i en stillstand preget av ensformighet. Hverdagen hennes er nå fylt med rutiner i samspillet med både mor og datter. Kei begynner å ta gjentatte turer til den idylliske kystbyen Manazuru, et sted som vekker minner fra en tid hun aldri helt klarer å plassere. Disse besøkene gir henne rom til å reflektere over livets usikkerhet og vekker en dyp lengsel etter å finne noe tapt. Gjennom en poetisk fortelling som fletter sammen surrealistiske og groteske elementer, kommer det frem en stillferdig ømhet fra de mørke stundene i livet hennes. Manazuru er en meditasjon over hukommelse og utforsker på dyp, presis måte relasjonene mellom elskede og familiemedlemmer.