I "BattleTech: Burden of Proof" følger vi den dramatiske kampen om planeten Stewart, som er hjemsted for en av de eldste dynastiene i Free Worlds League. Denne planeten har lenge vært under kontroll av Clan Wolf, takket være en avtale om gjensidig ikke-aggresjon mellom Wolf Empire og League. Nå har imidlertid Wolves uventet forlatt mye av sitt territorium, noe som gir en unik mulighet for Count Gavin Stewart og hans enhet, Silver Hawk Irregulars, til å gjenerobre familiens hjemland i løpet av Wolves fravær. Men denne invasjonen kan destabilisere hele regionen. Captain Trenton Marik, en nær venn av Gavin, ser den langsiktige faren og må reise til Stewart for å overbevise Gavin og Irregulars om å trekke seg tilbake før Wolves returnerer med full styrke for å slå tilbake. Samtidig avdekkes rykter om en erobrer som krever lojalitet fra alle Claner, noe som skaper delte lojaliteter innen Clan Protectorate-provinsen i League. Spenningen mellom lojaliteter og plikter gjør historien til en nervepirrende reise gjennom maktkamper og moralske dilemmaer.
