I "Ogami-san Can't Keep It In 3" følger vi den unge videregående jenta Ogami-san, som strever med å kontrollere sine fantasier og impulser. Hun har en hemmelighet som hun må skjule for vennene sine: Puberteten har etterlatt henne med en overflod av perverse tanker som hun desperat prøver å holde under kontroll for å leve et normalt skoleliv. Men alt endrer seg når hun tappert rekker ut hånden til Yaginuma-kun, en søt, men mystisk gutt fra klassen. I det øyeblikket sprer hennes innerste tanker seg ukontrollert. Hennes ønske om å bli kjent med ham (og kroppen hans) gjør situasjonen enda mer komplisert, ettersom hun risikerer å avsløre sitt sanne jeg. Hva kan en jente gjøre i en slik skremmende og pinlig situasjon? Bli med på en latterfylt og skrullete reise gjennom ungdomstidens vanskeligheter, fylt med romantikk og uventede vendinger.