Spillet er i gang! MBI har stengt av Shintou Teito og innledet den andre fasen av Sekirei-prosjektet! Når Sekirei forbereder seg på å kjempe for å overleve, øker presset for de som ennå ikke har fått sine Ashikabi, for å finne dem før det er for sent. Men hva skjer når en Sekirei ønsker å ha ingenting med sin Ashikabi å gjøre? Dette gjelder Tsukiumi, som har funnet den perfekte løsningen—hvorfor ikke bare drepe ham? Er det plass i Minatos haremsstruktur for én til?