Før Mysterious Benedict Society eksisterte, var det bare en gutt ved navn Nicholas Benedict. Bli kjent med barnet som startet det hele. Ni år gamle Nicholas har flere utfordringer enn de fleste barn i hans alder. Han er foreldreløs, har et uheldig utseende, og lider av narkolepsi – en tilstand som gir ham mareritt og får ham til å sovne i de mest upassende øyeblikk. Nicholas blir sendt til et nytt barnehjem, der han møter sultne mobbere, egoistiske voksne, underlige omstendigheter – og en gåte som kan forandre livet hans for alltid. Heldigvis har han én viktig fordel: Han er et geni. I sin søken etter å løse mysteriet finner Nicholas fiender rundt hver sving, men også venner på de mest overraskende steder. Underveis oppdager han at den største gåten av dem alle, er seg selv.
