I 'Darkness Comes In Like A Flood' følger vi Loren og Eve Montcrest, et par som nettopp har blitt kristne, og som nå befinner seg i en uventet åndelig kamp. Etter sitt dåp blir de umiddelbart kastet ut i en intens spirituell storm, hvor de møter angrep fra Arcane Institute og deres Harmony-samfunn. Ledelsen innen Harmony trekker ut alle midler i kampen for å gjenerobre eller utslette de tidligere disiplene. Samtidig må Loren og Eve konfrontere sine egne synder, den falne verden de lever i, og de stadige demoniske bedragene og angrepene som hindrer deres vei. Som den andre romanen i Omega Point-serien tar fortellingen dem gjennom intriger og moralske utfordringer mot det himmelske løftet. De står under veiledning av Alexander Renkin, lederen av en hemmelig undergrunnskirke. Men Alexander befinner seg også i en usikker situasjon som den nominelle lederen av lokal KINDness-kirke, som er en del av Harmony. Han stiller spørsmål ved hva Loren og Eve vil være villige til å ofre og lide for sin nye tro når de virkelig prøvelser kommer. En mektig bevegelse av Den Hellige Ånd truer med å forstyrre deres planer og sette dem på prøve som aldri før.
