I 'Lost Fleet' tar Jack Campbell oss med inn i en spennende sci-fi verden der to stjernesystemer under Syndikatet er blitt utsatt for angrep fra en mystisk flåte av krigsskip som styres utelukkende av kunstig intelligens. Kaptein Geary er kjent med disse krigsskipene, ettersom de ble utviklet av hans eget regjering for å beskytte, men som nå har havnet i en tilstand av funksjonsfeil. Hvis Syndikerne får vite sannheten om opprinnelsen til disse AI-kontrollerte skipene, vil krigen med Alliansen blusse opp igjen med full styrke. Mens regjeringen prøver å skjule både eksistensen av AI-krigsskipene og sin egen rolle i deres utvikling, må Geary navigere gjennom farene for å lokalisere skipene og deres hemmelige base i det angivelig mytiske stjernesystemet Unity Alternate. Geary er fast bestemt på å stoppe konflikten, uansett hva det måtte koste.
