I "The Last Remains: A Mystery" står arkeolog Dr. Ruth Galloway overfor en dyster virkelighet da beinrestene av en savnet kvinne blir oppdaget under renoveringen av en kafé. Dette uventede funnet tvinger både Ruth og DCI Nelson til endelig å konfrontere de underliggende følelsene de har for hverandre, samtidig som de må jobbe hardt for å rense navnet til en av sine egne. Beinrestene viser seg å tilhøre Emily Pickering, en ung arkeologistudent som forsvant i 2002. Mistankene rettes snart mot Emilys veileder fra Cambridge, samt en annen arkeologientusiast fra den samme helgen før hun forsvant – Ruths venn Cathbad. Mens Nelson og teamet hans dykker dypere inn i saken, avdekker de et komplisert nett av relasjoner innen arkeologigruppen og ser etter forbindelser mellom dem og kaféen der Emilys bein ble funnet. Dette er en spennende og følelsesladet mysteriet som ikke kan gås glipp av.