I 1613 legger fire lavrangerte japanske samuraier, sammen med en spansk prest, ut på en reise til Mexico for å forhandle om handelsrettigheter med Vesten i bytte mot en katolsk korstog gjennom Japan. Deres krevende ferd varer i fire år, da de reiser videre til Mexico og deretter til Roma, hvor de overbevises om at suksessen av deres oppdrag avhenger av deres konvertering til kristendommen. Faktisk virker prosjektet å ha vært fruktesløst fra begynnelsen av: når misjonen vender tilbake til Japan, oppdager de at de politiske vindene har snudd. Myndighetene fører nå en isolasjonistisk politikk og jakter hensynsløst på vestlige påvirkninger. Midt i desillusjon og død kan samuraiene kun finne trøst i en frelser de er usikre på om de virkelig tror på.