Selv om Mendelssohn var mest kjent i sin samtid som komponist, virtuos pianospiller og dirigent, hadde han også et enestående rykte som en dyktig organist. Instrumentet fanget hans interesse - man kan nesten si at det mesmeriserte ham - fra ung alder. Til tross for at han fikk noen års formell opplæring rundt tolv eller tretten år gammel, var han stort sett selvlært. Han innehar aldri en stilling som kirkeorganist, og han hadde ingen elever i orgelspill. Likevel hadde instrumentet en helt spesiell betydning i hans personlige liv. I løpet av sine mange reiser, enten han befant seg i større byer eller små landsbyer, tiltrakk han seg alltid orgellofter, hvor han kunne tilbringe timer med å spille verk av Bach eller rett og slett improvisere. Mens pianoet åpenbart fungerte som et praktisk instrument for Mendelssohn, ser det ut til at orgelet var hans foretrukne valg. Han oppsøkte orgellofter, ikke av nødvendighet, men av lyst, fordi det var på orgelet han kunne finne sin autentiske stemme.
