I milliarder av år har mikrober vært avgjørende for produksjonen og konsumet av klimagasser som regulerer den globale temperaturen og dermed også andre aspekter av vårt klima. Balansen av disse gassene er nødvendig for å opprettholde livsforholdene på Jorden. Metan, en klimagass som kun produseres av mikrober, kan ha vært med på å forhindre en dyp nedkjøling av Jorden for milliarder av år siden. På tilsvarende vis hjelper variasjonene i karbondioksid, en annen klimagass produsert av mikrober og andre organismer, med å forklare opp- og nedturene av istider de siste millionene av år. I dag står vi overfor en menneskeskapt klimakrise med dramatiske konsekvenser. Den komplette historien bak klimagasser omfatter imidlertid mikrober og deres rolle i naturlige økosystemer. Mikroskopiske organismer er også en del av løsningen, ved å produsere biodrivstoff og andre former for grønn energi som reduserer behovet for fossile brensler. Andre mikrober kan bli utnyttet for å redusere utslippene av metan og lystgass fra landbruket, og geoingeniørløsninger som er avhengige av mikrober kan bidra til å trekke ned nivåene av disse gassene i atmosfæren.
