I 1939 blir fem år gamle Jacques Austerlitz sendt til England på en Kindertransport og plassert hos fosterforeldre. Det barnløse paret fjerner raskt all kjennskap til guttens identitet, noe som fører til at Austerlitz vokser opp uten kjennskap til sin fortid. I løpet av livet, etter en karriere som arkitekturhistoriker, unngår han bevisst alle ledetråder som kan lede ham tilbake til sine røtter. Imidlertid begynner fortiden å hjemsøke ham, og han blir tvunget til å konfrontere hendelsene som skjedde for femti år siden. Austerlitz er en dyptgående utforskning av identitet, minne og de uunngåelige konsekvensene av det skjulte.