Botchan er en moderne ung mann fra Tokyo, som etter foreldrenes død blir sendt til det ultratradisjonelle Matsuyama-distriktet for å arbeide som matematikklærer. Med en sarkastisk, opprørsk og umoden holdning står Botchan overfor en rekke utfordringer. I møte med en ny og fremmed kultur blir han konfrontert med sine egne verdier og den strenge disiplinen i det japanske utdanningssystemet. Romanen gir et morsomt og tankevekkende innblikk i Botchans indre kamp, og utforsker temaer som identitet, tilhørighet og motstanden mot autoritet.