I 'Helenes krig' blir leseren tatt med på en nervepirrende reise gjennom en ung jentes liv i tumultene av andre verdenskrig. Helene, som er en veloppdragen og borgerlig jente, begynner studiene ved Københavns Universitet. I løpet av denne urolige tiden møter hun nye venner og blir gradvis dratt inn i en motstandsbevegelse. Det begynner uskyldig med distribusjon av illegale flygeblader, men situasjonen eskalerer raskt til mer risikable oppdrag som bringer både hennes liv og de rundt henne i fare. Helene går fra å være en enkel budbringer til å bli en sentral aktør i motstandsarbeidet, der hun tar på seg roller som kurér og til slutt skarpskytte. Men under disse dramatiske omstendighetene bærer hun på en hemmelighet; kjærligheten hennes til en mann som har nære forbindelser til de tyske okkupasjonsstyrkene. Helenes indre konflikt mellom lojalitet til motstandsgruppen og følelsene for mannen hun elsker, setter hennes moralske kompass på prøve. 'Helenes krig' er ikke bare en historie om mot og motstand, men også om kjærlighetens kompleksitet i en tid preget av krig og utfordringer.