Den magiske Peter Pan besøker natthjemmet til Darling-barna, Wendy, John og Michael. Han lærer dem å fly, før han tar dem med på en eventyrlig reise over nattehimmelen til Den forunderlige landet, hvor de møter røde indianere, ulver, havfruer og... pirater. Kaptein Hook, lederen av piratene, er en skummel skikkelse; han har mistet hånden sin til en krokodille, som ifølge Hook har fulgt ham siden den gang, sultent slikkende leppene for å få smake mer. Gjennom mange spennende eventyr bygger historien seg opp mot et gripende klimaks, der Peter, Wendy og barna konfronterer Kaptein Hook og hans gjeng i et storslått oppgjør.