Boken 'Homology, Genes, and Evolutionary Innovation' representerer en betydelig syntese av homologi, skrevet av en ledende forsker innen feltet. Homologi, som refererer til liknende trekk delt av ulike arter med felles forfedre, som for eksempel finne til en sel og vinge til en fugl, er et av de mest grunnleggende, men utfordrende konseptene innen evolusjonsbiologi. Denne banebrytende boken presenterer den første mekanisk baserte teorien om hva homologi er og hvordan det oppstår i evolusjonen. Günter Wagner, en av de fremste forskerne på området, argumenterer for at homologi, eller karakteridentitet, kan forklares gjennom den historiske kontinuiteten av karakteridentitetsnettverk, det vil si de genregulerende nettverkene som muliggjør differensiert genuttrykk. Han viser hvordan karakteridentitet er uavhengig av formen og funksjonen til selve karakteren, ettersom det samme nettverket kan aktivere forskjellige effektorgen og dermed kontrollere utviklingen av ulike former, størrelser og kvaliteter av karakterene. Boken demonstrerer hvordan denne teoretiske modellen kan bli et fundament for videre forskning.