I en intens maktkamp, der begge parter er forberedt på kamp, må Jedi-ordenen og Den galaktiske alliansen finne en løsning før Siths mørke hær tar sin hevn. Konsekvensene av Jacen Solos fatale tilknytning til den mørke siden og den mystiske galskapen som rammer de unge Jedi, fortsetter å skape kaos i hele galaksen. Luke og Ben Skywalker er på jakt etter den nå masteløse Sith-lærlingen, en forfølgelse som tar dem til den uhumske planeten Dathomir, hvor Skywalkerne blir tvunget til å kjempe både for byttet sitt og sine egne liv. Samtidig har Han og Leia fullført sin egen desperate oppgave med å frakte de galskapssyke Jedi til et trygt sted, utenfor rekkevidden til Den galaktiske alliansens leder, Natasi Daala. Likevel er det ingen større trussel enn Abeloth, et vesen av grådig mørk energi som lokker til seg både Jedi og Sith. For noen kan det være den ultimate kilden til svar for overlevelse, mens det for andre kan bli det ultimate våpenet for erobring. Men for alle er dette et møtested som vil endre spillet på uante måter.
