Etter Jokeren død står Batman og Gotham City overfor en mystisk ny trussel i denne direkte oppfølgeren til Tim Burtons ikoniske Batman. Selv om Jokeren er død, lever hans skygge fortsatt over byen. Gotham er reddet, men det er fremdeles langt fra trygt. Om natten fortsetter Batmans nye symbol på håp sin kamp for å beskytte uskyldige og maktesløse. I løpet av dagen undrer hans alter ego, Bruce Wayne, på om det en dag kan finnes en fremtid uten å snike seg rundt på takene i byen eller i de store salene i hans storslåtte herskapsbolig sammen med den trofaste Alfred Pennyworth. Likevel, selv etter sin død, er innflytelsen fra Klovnenes prins fortsatt merkbar, ikke bare i gatenes asfalt. Rester av Jokeren sin bande leder tilhengere som er fascinert av hans bisarre mystikk på en brannstiftende kampanje som truer byen, samtidig som det gagner grådige opportunister, inkludert millionær Max Shreck. I tillegg fyller overlevende fra eksponering for Jokeren sitt kjemiske våpen, Smylex, den store sykehuset i Gotham. For å dempe kaoset trenger Batman mer enn bare sine vanlige metoder.
